工伤二次住院费用应由工伤保险基金或用人单位承担。根据《工伤保险条例》，二次手术仍属工伤范围，费用应由保险或单位支付。不及时处理可能导致劳动者权益受损，影响治疗与康复。
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工伤二次费用处理：1. 已参保：向工伤保险机构提交二次住院费用单据，申请报销。2. 未参保：与用人单位协商，要求支付二次住院费用；协商不成，可申请劳动仲裁或诉讼。3. 保留证据：无论哪种方式，均需保留好医疗费用单据、诊断书等证据。
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工伤二次住院费用常见处理方式为申请工伤保险基金支付或要求用人单位承担。选择时需确认是否已参加工伤保险，参保则向基金申请，未参保则向用人单位主张权益。