合同一式三份签了两份也生效。合同生效与份数无关，依据《民法典》，依法成立的合同自成立时生效。未及时处理可能导致合同无法履行，产生违约责任。
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合同两份也生效。操作如下：1. 确认合同内容完整无误；2. 双方当事人在合同上签字或盖章；3. 各自保留一份合同作为凭证；4. 如需备案或审批，及时办理相关手续。
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合同一式三份签两份的处理方式是确认合同内容无误后，双方签字盖章即生效。选择处理方式时，应确保合同内容合法、双方意愿真实，并妥善保管已签合同。