您询问的借款50000元，两年利息按照年利率24%计算是否合法的问题，根据2015年9月1日起实施的《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》，年利率24%以内的利息约定是合法的，出借人请求借款人按照此利率支付利息的，人民法院应予支持。因此，您所提到的利息计算方式是合法的，并受到法律保护。
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若借款利息超过了年利率36%，根据《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》，超过部分的利息约定无效。借款人可以要求出借人返还已支付的超过年利率36%部分的利息，人民法院应予支持。这意味着，超出部分的利息不受法律保护，借款人无需支付。
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在法律允许的范围内，借款利息的设定应遵循以下原则：首先，利息不应超过年利率24%，以确保其合法性并受到法律保护；其次，若双方愿意承担更高风险，可在年利率24%至36%之间自由议价，但需注意此区间内的利息在产生纠纷时可能不被法院完全支持。因此，合理设定利息应兼顾合法性与双方风险承受能力。